Stockholms stad har tagit fram ett program för vattenvårdsarbetet, som gäller för åren 2006 till 2015. Programmet innehåller mål och åtgärder för hur vi ska få renare vatten i Stockholms sjöar och vattendrag samt värna och utveckla vattenområdena ur rekreationssynpunkt. Vattenprogrammets övergripande mål är indelade i två målområden: Miljökvalitet och Rekreation.
Miljökvalitet
Stockholm ska ha en god vattenstatus. Senast 2021 ska Stockholms vattenområden uppnå den status som föreskrivs i EG:s ramdirektiv för vatten.
Mål i vattenprogrammet
Kvaliteten på tillrinnande vatten »
Kvaliteten på tillrinnande vatten ska vara sådan att en god vattenstatus uppnås i stadens vattenområden.
Åtgärdsstatus: 
Volymen tillrinnande vatten »
Volymen tillrinnande vatten till stadens sjöar och vattendrag ska bibehållas eller ökas.
Åtgärdsstatus:
Biologisk mångfald »
Mark och vatten ska ge förutsättningar för en rik biologisk mångfald.
Åtgärdsstatus:
Förorenade mark- och sedimentområden »
Förorenade mark- och sedimentområden som medför stor påverkan på yt- och grundvatten ska saneras.
Åtgärdsstatus:
Kompensation vid exploatering »
Exploatering av vattenområden ska kompenseras med likvärdiga kvaliteter inom samma vattenområde.
Ansvarig organisation: Miljöförvaltningen
Kontakt: Magnus Sannebro, Miljöförvaltningen
Länkar
Inventering förorenade markområden 2011 (länk till annan webbplats)
Länsstyrelsen inventerar förorenade markområden i länet, läs mer här och ladda hem rapport.