BQI, Benthic Quality Index, är ett index som visar effekter av näringspåverkan i sjöarnas djupare delar (profundalen). Det man framför allt tittar på är olika arter av fjädermyggor, som är olika känsliga för låga syrgashalter. Förekomsten av individer och olika arter ger en indikation på hur näringspåverkad sjön är under större delar av året än vid provtagningstillfället och kompletterar därmed direkt provtagning av näringsämnen.
För att statusklassa en sjö utifrån BQI-värdet måste man ta hänsyn till sjötyp, djup samt andra påverkande faktorer. Detta resulaterar i en ekologisk kvot (EK). Det är den ekologiska kvoten som kan jämföras med gränsvärden och miljökvalitetsnormer.
Utvecklingen går åt rätt håll sedan 2005