Kärlväxtarterna, dvs alla örter, gräs, halvgräs, ormbunkar, fräken och lummer, är många i Stockholm. Stadens flora har en blandning av växter som fanns i det tidigare jordbrukslandskapet och sådana som förts in till de urbana miljöerna i modernare tid. Totalt rör det sig om över 2 000 arter.
Stockholms stad är ett av landets mest välinventerade områden, där många kunniga botanister samlat växter. Av den särskilt skyddsvärda floran finns idag kvar drygt 120 arter som är med på den nationella s k rödlistan. Dessa utgör endast en del av de rödlistade arter som historiskt noterats i kommunen. Ytterligare ett drygt hundratal arter av kärlväxter betraktas som lokalt skyddsvärda i Stockholms stad.
Exempel på ovanliga kärlväxter som trivs i rester av gamla slåtter- och betesmarker är backsippa och korskovall. I stenstadens mer omrörda miljöer har konkurrenssvaga rödlistade arter som paddfot, spetsfingerört och knippnejlika etablerat sig.
*Rödlistan utgör en bedömning av enskilda arters risk att dö ut från Sverige, utifrån internationella kriterier. Att en art är rödlistad innebär i sig inget skydd men signalerar om att hänsyn behövs.