Eken är värd för en mängd andra arter och för med sig stora naturvärden, men hotas generellt av igenväxning och brist på föryngring. Ogynnsam skötsel, där man inte gallrat för att ekarna ska få solinstrålning och växa sig stora, orsakar stora förluster av arter som är knutna till ek.
Miljömiljardprojektet "Stockholms unika ekmiljöer" genomfördes 2005-2007 inom vilket stadens viktiga ekområden, jätteekar och deras sköteselbehov identifierades och beskrevs i en rapport. Det digitala kartunderlaget som togs fram, "Ekdatabasen", finns idag tillgängligt som s k WMS-tjänst via stadens öppna data (Dataportalen) samt i stadens interna kartverktyg. 2017 uppdaterades Ekdatabasen med avseende på skötselstatus för ekarna samt kompletterades med jätteekar som inte hade upptäckts tidigare. Rapporten från uppdateringen samt den tidigare rapporten kan laddas ner här intill (materialet på Dataportalen är dock ännu inte uppdaterat).
Stockholm stad planerar och genomför åtgärder som gynnar ekmiljöer. Ett stort antal ekdungar kommer att gallras och röjas som en del av satsningen Grönare Stockholm. På så sätt gör vi också en insats för över 1 500 andra arter som är mer eller mindre är beroende av eken som livsmiljö.
