Den fysiska livsmiljön för vattenlevande organismer sammanfattas i begreppet hydromorfologi, som innefattar såväl flöden som utseende, form och funktion hos ekosystemet.
På flera platser är det tekniskt omöjligt eller ekonomiskt orimligt att återställa den påverkan som en flerhundraåriga stad utgör. Huvudsyftet med de föreslagna åtgärderna i utredningarna är därför inte att återställa till ett opåverkat tillstånd utan snarare att förbättra livsmiljöerna så långt det är möjligt samtidigt som staden växer och utvecklas. Med hjälp av både naturliga och tekniska innovativa lösningar går det att göra mycket för att förbättra livsmiljöerna och förutsättningarna för fisk och annan fauna.