Inom Magelungens avrinningsområde finns cirka 250 enskilda avlopp, varav de flesta ligger i Huddinge kommun. Områden i Svartvik, Nordvästra Länna och Lyckåsen finns med i kommunens VA-utbyggnadsprogram och är planerade att anslutas till det kommunala VA-nätet. Några spridda fastigheter med enskilt avlopp ligger i Stockholm stads del av avrinningsområdet. Det finns inga enskilda avlopp med utsläpp till recipient inom Forsåns avrinningsområde.
Följande områden bör prioriteras:
- Lyckåsen
- Svartvik
- Nordvästra Länna