Sjön har en yta på 0,63 km2 och ingår i Tyresåns huvudavrinningsområde. Vattentillförseln till Flaten utgörs huvudsakligen av dagvatten från Skarpnäck och avrinning från omgivande naturmark. Utflödet går via Orhemsbäcken och vidare ut i Drevviken i söder
Större delen av sjöns tillrinningsområde ligger inom Flatens naturreservat och omgivningarna utgörs av relativt liten andel exploaterad mark. Närområdet utgörs av skog, koloniområden, Orhems gård, campingar och badplatser. Skogen som omger sjön karakteriseras av kuperad hällmarkstallskog samt av fuktlövskog i de lägre belägna partierna längs stränderna.
I sjöns nordöstra vik ligger två EU-bad, Flatenbadet allmänna och Flatenbadet barnbadet. Vattenkvaliteten vid badplatserna klassas som utmärkt.